puma femme

Das Forum für Kizashifreunde
Antworten
Tina Gibbon
Beiträge: 3
Registriert: Do 5. Dez 2019, 08:25

puma femme

Beitrag von Tina Gibbon » Do 5. Dez 2019, 08:27

Nous avons également utilisé AIS pour effectuer une analyse puma femme d'autocorrélation spatiale de l'ensemble de données, en utilisant 11 classes de distance, des tailles d'échantillon égalisées pour toutes les classes et 10 000 permutations pour évaluer l'importance.Enfin, nous avons effectué une série d analyses pour étudier l histoire démographique des pumas. Nous avons effectué des tests de neutralité avec DnaSP.

Nous avons supposé que les pumas et les jaguarundis divergeaient entre 3,16 et 6,01 MYA (95% HPD de l'estimation rapportée par Johnson et al. (2006) en utilisant une supermatrix nucléaire). Nous avons appliqué un uniforme avant en utilisant ces âges comme limites minimales et maximales conservatrices, respectivement. La dernière analyse était puma r698 basée sur 10 8 générations MCMC, avec des échantillons prélevés toutes les 10 4 étapes et les 10 premières étapes supprimées lors de l inactivation.

Est de l'Amérique du Sud (ESA, en vert clair), centre-sud de l'Amérique du basket puma femme Sud (CSSA, en bleu clair) et sud-ouest de l'Amérique du Sud ( SWSA, en violet).L'ensemble de données puma contenait 33 sites variables (32 transitions et une transversion), dont 25 étaient informatifs sur le plan phylogénétique (tableau 1). Au total, il y avait 28 haplotypes, dont 22 en Amérique du Sud (H01 H22), l'un d'eux (H09) étant partagé avec l'Amérique centrale (Figure 2A).

Lorsque les séquences de P. yagouaroundi étaient utilisées en puma basket tant que groupes externes dans le réseau (figure 2A), elles étaient reliées par 85 étapes mutationnelles à l'haplotype H01 de puma, supportant cette position pour la racine de puma mn. L'haplotype H01 se trouve dans le centre de l'Amérique du Sud (le Paraguay, ainsi que dans les États brésiliens MS, SP et MG), se différenciant par au moins six étapes mutationnelles des principaux haplotypes d'Amérique du Nord et d'Amérique centrale.

Lorsque la séquence de M. trumani était incluse dans le réseau (figure 2B), la longueur de l'alignement de la séquence était réduite à 286 pb pour correspondre au segment disponible pour ce groupe de sortie. En raison de cette réduction du nombre de sites, le réseau est devenu moins résolu, puma trinomic r698 mais les résultats suggèrent toujours que le groupe externe était plus étroitement connecté aux pumas d'Amérique du Sud et du Sud de l'Amérique centrale qu'aux haplotypes du Nord de l'Amérique centrale et du Nord.

Les analyses bayésiennes effectuées avec Beast ont également permis de mieux comprendre les pumas de la démographie historique révélés par l ADNm. Lors de la première série d'analyses, utilisant cinq individus présentant les haplotypes les plus divergents et deux jaguarundis, nous avons estimé le taux de substitution du segment ND5 analysé à 2,054% par million d'années. En Bild appliquant ce taux de substitution dans le deuxième ensemble d'analyses.

Antworten